חאלד שייח מוחמד, אשר תכנן עבור אל-קאעידה את פיגועי 9/11, יודה באישומים נגדו ויישלח למאסר עולם - נקבע בהסדר טיעון בינו לבין משרד ההגנה האמריקני (31.7.24). בלא ההסדר, הייתה התביעה מבקשת לגזור עליו עונש מוות. הסדר דומה הושג עם עוזריו, וליד בן-עטאש ומוסטפא אל-חווסאני.
התיק נגד השלושה, המוחזקים בידי ארה"ב מזה כ-20 שנה, מתנהל בבית המשפט במחנה הכליאה גוונטאנמו ביי, בחלק האמריקני של קובה. ההסדר כפוף לאישורו של בית הדין הצבאי, המורכב משלושה קצינים. את ההודעה עליו מסר התובע הראשי בתיק, תת-אדמירל אהרון רו, למשפחות הקורבנות בפיגועים הקשים ביותר שבוצעו אי-פעם בארה"ב. "בתמורה להסרת עונש המוות, שלושת הנאשמים הסכימו להודות בכל האישומים, כולל רצח של 2,976 בני האדם ששמותיהם צוינו בכתב האישום", כתב רו.
ארגוני זכויות אדם ומשפטנים מתחו ביקורת על ההליכים נגד השלושה, בשל הסודיות בה הם מתנהלים, טענות לניגודי עניינים והתמשכותם כאמור לאורך למעלה משני עשורים. סביר להניח שהתביעה גם לא רצתה לפתוח לדיון את שאלת היחס לנאשמים, לאור טענות רבות על עינויים בגוונטאנמו ביי, אשר אושרו בחלקן בדוח של הסנאט. קושי נוסף בניהול ההליך נבע מחוק שאישר הקונגרס ב-2015, ולפיו אסור לחשודים המוחזקים בבסיס זה להציב את כף רגלם בארה"ב, אפילו לצורך העמדה לדין - מה שחייב לנהל את המשפט בקובה.
רו מסר עוד, כי המו"מ על ההסדר נמשך שנתיים, וכי השלושה התחייבו גם לענות לשאלות של משפחות הקורבנות על חלקם בתכנון הפיגועים. בני משפחות יוכלו להעיד בשלב הטיעונים לעונש, הצפוי להתחיל לכל המוקדם בקיץ הבא. ההסדרים יוגשו לבית המשפט בספטמבר או אוקטובר הקרובים, ומאחר שהשלושה כלואים ממילא - אין חיפזון בהשלמת ההליך.
כתב האישום המקורי של מוחמד, בן-עטאש ואל-חווסאני הוגש ב-2008, אך התביעה חזרה בה לאחר שנתיים, כאשר ממשל אובמה ביקש לנהל את ההליכים בניו-יורק - זירת הפיגוע המרכזי, במגדלי התאומים. אולם, כתב האישום הוגש מחדש בגוונטנאמו ביי ב-2011, לאחר שהממשל נכשל במימוש הבטחתו של הנשיא ברק אובמה לסגור את המחנה.
לאחר שנים כה רבות של עיכובים, חלק מבני המשפחות החלו לחשוש שהמשפט לעולם לא יתנהל ומאז 2017 לחצו חלקם להגיע להסדר טיעון - כדי להבטיח הרשעה וענישה. "אמרנו שצריכה להיות דרך שונה להשיג מידה כלשהי של צדק ונטילת אחריות", אומר טרי רוקפלר, שאחותו נרצחה במגדלי התאומים.
הרווי רישיקוף, שהיה בעבר תובע בתיק ופוטר בידי הפנטגון, אמר לוושינגטון פוסט, כי ההסדר הוא המוצא הטוב ביותר - שכן במצב המשפטי הקיים, קלושים הסיכויים שבית משפט לערעורים היה מאשר עונש מוות. הקשיים בתיק נובעים מכך שהסניגורים קיבלו גישה רק לתמציות של ראיות מסווגות ומשום שהעינויים שעברו הנאשמים פסלו את כל הודאותיהם.