מישור חשוב נוסף של התמודדות עם המחלה הינו פרויקט החיסון האוראלי. חיסון זה ניתן לשועלים ותנים באמצעות פיזור פיתיונות הנושאים את החיסון מן האוויר. הפיתיונות מושלכים מכלי טייס קלים והם נראים כקופסאות גפרורים קטנות בצבע חום בעלות ריח המושך את השועלים והתנים. כאשר בעל החיים נוגס בהם, מגיע התרכיב למגע עם ריריות הפה וגורם להתחסנות בעל החיים. גודל הפיתיון מותאם לגודל וצורת הלסת ומאפשר וודאות גבוהה במיוחד שכאשר הוא ייאכל, בעל החיים יחוסן.
על בני האדם להימנע ממגע עם פיתיונות אלו, על-אף שהם אינם מסוכנים.
פרויקט החיסון הארצי של שועלים ותנים כנגד הכלבת החל בניסויי שדה בשנת 1998 בעקבות התפרצות המחלה בשועלים, ובעקבות שלושה מקרי מוות של בני אדם שחלו בכלבת.
קדם לפיזור מחקר שנערך על-ידי השירותים הווטרינרים במשרד החקלאות ורשות הטבע והגנים, בו הוכחה יעילות השיטה של פיזור תרכיבים מהאוויר, בחיסון השועלים והתנים בתנאי השטח של המדינה וכן נעשה ניסוי מעשי של פיזור החיסון בצפון הארץ, באזור בו הייתה שכיחות המחלה גבוהה במיוחד. החל משנת 1998 ועד היום פוזרו 5 מיליון פיתיונות. במהלך בדיקת השיטה נמצא כי חיסון בדרך זו אינו מתאים לכלבים, ועל כן מושם דגש נרחב על איסוף כלבים משוטטים וחיסון כלבים ביתיים.
החיסון האוראלי תרם לכך שבשנים האחרונות לא נצפו כלל מקרי הידבקות בקרב שועלים. בקרב התנים, לעומת זאת, נרשמה עלייה בהידבקות, כאמור בגלל הנגיף הייחודי שפוגע בעיקר בכלבים ודומיהם.
ועדת ההיגוי הבינמשרדית, שמונתה לטיפול בהתפרצות מחלת הכלבת קבעה כי פיזור החיסון האוראלי הוא אחד הכלים הטובים והיעילים בהם ניתן לעשות שימוש להכחדת המחלה בקרב אוכלוסיית התנים.
ד"ר בוריס יעקובסון, האחראי על הפרויקט בשירותים הווטרינריים במשרד החקלאות ופיתוח הכפר: "גודל אוכלוסיות התנים בארץ וצפיפותם גבוהים מאוד ולכן עלינו לחסנם באופן האפקטיבי ביותר, לשם מניעת התפרצות גדולת ממדים של המחלה. החיסון האוראלי הוא כלי שהוכח לאורך השנים כיעיל ביותר בהתמודדות עם מחלת הכלבת בקרב חיות בר".
השירותים הווטרינרים במשרד החקלאות קוראים לציבור הרחב לא לאסוף כלבים שאינם מוכרים להם מהרחוב, ולדווח לעירייה על כלבים משוטטים. בעלי הכלבים נדרשים להקפיד לחסנם נגד כלבת מדי שנה (על-פי חוק) ולהקפיד לטייל עימם עם רצועה. שחרור כלבים באופן חופשי, עלול להביאם במגע עם בעלי חיים אחרים החולים בכלבת, ובכך להכניס את המחלה הביתה, באמצעות הכלב הביתי ולסכן את בני המשפחה.
