קשר מעניין מתקיים בין מחלת הטרשת הנפוצה למגדר. נתחיל מכך שמחלת הטרשת הנפוצה שכיחה יותר אצל נשים, כאשר למעשה הסיכוי של אישה לחלות גדול פי שלושה מאשר של גבר (ואצל גברים מחלה קשה יותר קשורה ברמות נמוכות של טסטוסטרון, "ההורמון הזכרי").
עם זאת, אופי המחלה קשה יותר אצל גברים מאשר אצל נשים. גם לפרופיל ההורמונלי אצל הנשים, יש השפעה שונה על אופי המחלה: במהלך ההריון השכיחות של התקפי המחלה הולכת ויורדת ומגיעה למינימום בשליש האחרון של ההריון, אף כי לאחר העלייה שיעור ההתקפים גדל. במהלך טיפולי פוריות יש עלייה בשכיחות ההתקפים ואילו בתקופת גיל המעבר שכיחות ההתקפים יורדת.