גורמים בחמאס טוענים כי הפיגוע שעשו פעילי הזרוע הצבאית עז א-דין אל-קסאם ביישוב עלי מעידה על ההחלטה של הזרוע הצבאית, להגביר את פעילות הטרור ביהודה ושומרון מעבר לצפון השומרון. חמאס ינסה להגביר את הפיגועים בכל יהודה ושומרון ובקעת הירדן, בתיאום עם הג'יהאד האיסלאמי ו"משמרות המהפכה" האירניים, כדי לייצר מלחמת התשה נגד ישראל.
אירן מייחסת חשיבות רבה ליהודה ושומרון כחזית נוספת שתיפתח נגד ישראל. המנהיג העליון של אירן עלי ח'מינאי, שנפגש השבוע בטהרן עם משלחת של חמאס, אמר לה: "רצועת עזה היא מרכז ההתנגדות, אך הגדה המערבית היא זו שתביס את ישראל".
גורמי ביטחון בישראל אומרים כי צאלח אלעארורי, ראש הזרוע הצבאית של חמאס ביהודה ושומרון, הוא האחראי לפיגוע הרצחני ביישוב עלי וכי מבחינת ישראל הוא "בן מוות".
צה"ל ממשיך בינתיים במעצרים יומיים של מבוקשים בכל רחבי יהודה ושומרון ובהריסות בתיהם של מחבלים רוצחים. לצבא יש תוכניות מגירה לפעולות מיוחדות נגד מוקדי הטרור, אך הוא ממתין להזדמנות המתאימה להפתיע את המחבלים, שנמצאים במצב של כוננות עליונה בעקבות הפיגוע בישוב עלי.
גורם ביטחוני בכיר אומר כי החזרה למדיניות החיסולים הממוקדים היא צעד נכון, אך הוא הגיע באיחור וכי בסופו של דבר מדיניות החיסולים הממוקדים איננה יכולה להביא להריסת תשתיות הטרור של יותר מ-20 קבוצות חמושות. הוא העריך כי לא יהיה מנוס וצה"ל יהיה חייב לצאת למבצע צבאי נרחב באזור השומרון.
ארגוני הטרור מאיימים כי המשך מדיניות החיסולים הממוקדים יביא לירי רקטות מרצועת עזה לעבר ישראל. ההערכה בצה"ל היא כי בכל מקרה המצב הביטחוני ביהודה ושומרון יסלים, והוא נערך גם לאפשרות של סבב לחימה חדש בגבול רצועת עזה ולירי רקטות מדרום לבנון ומסוריה לעבר ישראל.
המעורבות האירנית הישירה בנעשה ביהודה ושומרון היא מדאיגה. אירן מזרימה כלי נשק ומימון לארגוני הטרור באמצעות הברחות משטח ירדן וישראל מתקשה בעצירת תופעת ההברחות.
קבוצות הטרור ביהודה ושומרון נהנות כיום מתיאום מבצעי הדוק עם ארגוני הטרור ברצועת עזה ומתמיכה אירנית בתחום החימוש והמימון וגם תמיכה מוראלית, דבר שמעניק רוח גבית לטרור.
הג'יהאד האיסלאמי הבטיח לנקום את מותם של שלושה אנשיו שחוסלו על-ידי המל"ט הישראלי. ההערכה במערכת הביטחון היא שהטרור יימשך במלוא העוצמה גם במהלך חג הקורבן (עיד אלאדחא) המתקרב, וכי ייתכן שגם מחבלים בודדים ינסו לבצע פיגועי נקם בתוך ישראל עצמה. הדבר מחייב ערנות מלאה של אזרחי ישראל ונשיאת נשק לכל מי שיש לו רישיון לכך. פיגועים "מוצלחים" הם דלק נוסף לטרור והם מעודדים פיגועי חיקוי, מערכת הביטחון מנסה לבלום את הטרור כדי שלא ישטוף את כל יהודה ושומרון ויגרור אותה לאינתיפאדה שלישית.
