דוח של משרד התחבורה שכותרתו "הפקקים באים! הפקקים באים!" נגנז זמן קצר לאחר פרסומו באוגוסט 2023, למרות שהכיל אזהרות חריפות מפני החמרה בגודש התנועה ברחבי הארץ עם תום חופשת הקיץ ותחילת שנת הלימודים. לפי המסמך, שנועד להתריע בפני קובעי המדיניות, צפויים עיכובים של שעה ומעלה בכבישים המרכזיים והידרדרות ניכרת באמינות התחבורה הציבורית. הפקקים כמצב קבוע הדוח מתאר תמונה עגומה של מערכת התחבורה: גודש חמור ההופך לשגרה, ירידה בעקביות ההגעה של אוטובוסים לתחנות לפי לוחות הזמנים, ופגיעה ישירה באיכות החיים של הנהגים והנוסעים. על-פי הנתונים שנאספו ממערכות ה־GPS של האוטובוסים, נרשמה ירידה באמינות השירות ברוב האזורים העירוניים, במיוחד לאחר החגים - תקופה שבה "אי הסדירות תעלה והתירות לא תספיק", כלשון המסמך. הדוח מדגיש כי אי־אפשר עוד להסתפק בהוספת נהגים או אוטובוסים, שכן "במקרים מסוימים ניאלץ לבטל נסיעות בכדי לתגבר קווים אחרים". המשמעות היא שקריסת הסדירות אינה רק בעיה זמנית, אלא מגמה מתמשכת המאיימת על יציבות המערכת כולה. הסרת המסמך והתגובה הרשמית למרות שהמסמך פורסם באתר משרד התחבורה, הוא הוסר בתוך זמן קצר. בתגובה נמסר מהמשרד: "הדוח הוסר מהאתר באוגוסט 2023 לצורך דיוק הניסוחים, שנועד למנוע פרשנות תקשורתית שגויה. לאחר השלמת התיקונים הועבר הדוח לגורמים הרלוונטיים לצורך העלאה מחודשת, אך פרוץ המלחמה הוביל להסטת המשאבים והקשב הציבורי והמקצועי לנושאים דחופים יותר. כעת, מאחר שהדוח התייחס לתחזיות שהיו רלוונטיות למצב התנועה ערב החזרה לשגרה — שלא התממשה בעקבות המלחמה - אין טעם לפרסמו מחדש". ההחלטה לגנוז את המסמך מותירה שאלות באשר לשקיפות וליכולת הציבור להיערך לעומסים צפויים. אף שהתחזיות אכן נכתבו לפני המלחמה, רבות מהבעיות שהוצגו - הגודש, חוסר הסדירות, הצורך בנהגים נוספים ובתשתיות עדכניות - ממשיכות להוות אתגר מהותי גם כיום. הדוח, שנכתב בסגנון ישיר ונטול מסיכות, נועד להתריע כי ישראל מתקרבת לנקודת רתיחה תחבורתית. כעת, כמעט שנתיים לאחר מכן, חלק ניכר מהתחזיות שבו מתממשות מדי יום בכבישים.